گروهک منافقین(یا به قول خودشان مجاهدین خلق) در طول هشت سال جنگ تحمیلی علیه ایران، به­طور کامل تحت اوامر مقامات امنیتی و نظامی عراق بود. منافقین دو خدمت بزرگ به رژیم بعث عراق می­کردند:

1-      جاسوسی و تأمین اطلاعات و اخبار برای ارتش عراق

2-      مبارزه­ی مسلحانه علیه جمهوری اسلامی ایران و ترور سران نظام

3-      شرکت در ترور و سرکوب مخالفان صدام در داخل کشور عراق (اواخر جنگ و بعد از آن)

با فرار بنی­صدر و رجوی به فرانسه، مرکز فرماندهی گروهک منافقین برای مدتی در این کشور متمرکز بود. در سال 1365 براساس مذاکراتی که میان رجوی و طارق عزیز صورت گرفت، گروهک منافقین به­طور کامل در عراق (عمدتاً در اردوگاه اشرف) مستقر شدند. از این تاریخ به بعد، گروهک مذکور به­طور کامل، مطیع اوامر صدام بودند.